北京市神经外科研究所15例样本的空间转录组检测项目遴选公告

北京市神经外科研究所15例样本的空间转录组检测项目遴选公告 根据工作安排，现面向社会公开遴选北京市神经外科研究所15例样本的空间转录组检测项目的承担单位，具体事项公告如下：一、委托单位北京市神经外科研究所二、项目基本情况名称项目名称：北京市神经外科研究所15例样本的空间转录组检测项目项目编号：F2024001三、项目内容采购项目的基本概况介绍：检测内容：15例神经纤维瘤病2型样本。检测方法：空间转录组测序分析。服务时间：自甲方确认开展实验之日起20个工作日。技术需求详见附件。四、项目预算项目预算资金为40万元（含税）。五、申请人资格条件（一）资格证明文件1.投标公司的营业执照等证明文件（提供复印件并加盖公章）2.法定代表人的授权委托书3.法定代表人及被授权人身份证复印件（须提供有效证件复印件并加盖公章）4.依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录的声明5.委托代理人和技术负责人纳税和社保的证明文件（近半年中的任意一个月）6.参加本次采购活动前三年内，在经营活动中没有重大违法记录的声明7.未被“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）列入失信被执行人和重大税收违法案件当事人名单、未被“中国政府采购网”网站（www.ccgp.gov.cn）列入政府采购严重违法失信行为记录名单（处罚期限尚未届满的）的声明（二）商务及技术文件1.报价一览表2.分项报价表3.技术偏离表4.同类服务在同级单位的销售合同5.实施方案6.技术人员团队介绍及支撑材料7.供应商简介8.关于售后服务、技术支持、培训的相关承诺六、申报和评审事宜1.申报期限：2024年1月24日至2024年1月30日。2.提交材料:申报单位根据申请人资格条件的相关内容，以响应文件为模板准备相应材料，内容应简明扼要，突出重点。在2024年1月30日17点前（以北京市神经外科研究所收到邮寄材料之日为准）将加盖单位公章的遴选响应文件一式三份递交至北京市丰台区南四环西路119号B区科研楼802室，或通过EMS邮寄至：北京市丰台区南四环西路119号B区科研楼，邮编：100070。请在信封封面标注“北京市神经外科研究所15例样本的空间转录组检测项目”字样，并注明申报单位联系人及联系电话。逾期递交的遴选响应文件恕不接受。3.组织评审：我单位将组织评审专家进行综合评审，择优遴选出1家单位。4.结果公示：评审工作结束后，将在首都医科大学附属北京天坛医院网站对遴选结果予以公告。七、联系方式北京市神经外科研究所联系地址：北京市丰台区南四环西路119号联系人：王老师 联系电话：010-59976742附件-评分标准-15例空间转录组.doc附件-技术要求-15例空间转录组.doc附件-响应文件.doc北京市神经外科研究所2024年1月24日北京市神经外科研究所15例样本的空间转录组检测项目评分标准评审因素评价指标和分值备注投标报价（10分）评标价格分数=（评标基准价/投标报价）×价格权重（10%）×100（注：实质性响应文件要求且价格最低的投标报价为评标基准价）客观商务部分20分）资质证书（6分）对供应商的①质量管理体系 ②健康管理体系 ③环境管理体系 三方面进行综合评价，每项得2分，最高得6分。（注：须提供证明材料，未提供者不得分）。客观商务部分20分）供应商业绩（9分）供应商近3年来从事医疗健康、卫生科研工作领域同类案例服务情况。每提供1份业绩得3分，最高得9分 。注：供应商需提供采购合同（含首页、金额页、签字盖章页），否则业绩不予认可。客观商务部分20分）科研研发水平（5分）对供应商的自主科研能力进行打分，供应商须提供与本项目研究类型相似服务的成果（专利、已发表SCI文章等证明材料），每提供一项得1分，最高得5分。注：供应商须提供证明材料（专利、文章中需体现供应商的名称），否则成果不予认可。客观技术部分（70分）技术规格要求的相应程度（24分）响应文件技术规格响应全部满足遴选公告技术要求第一条基本要求的为24分，其中有1项“#”号条款不满足的，扣3分；有1项其他条款不满足的，扣1分，最低得0分。（注：最低得分为0分时，将按照无效投标处理，予以拒绝。）客观技术部分（70分）实施方案（15分）根据供应商组织实施方案的完整性、可行性、合理性打分（包括时间进度表、工作程序和步骤、管理和协调方法、关键步骤的思路和要点等，及组织实施中可能遇到的问题及其应对措施的考虑情况）。实施方案完整性很好、可行性很好、合理性很好，得11-15分；实施方案完整性较好、可行性较好，得6-10分；实施方案完整性一般、可行性一般，得1-5分；未提供得0分。主观技术部分（70分）人员配置（9分）1.项目负责人具有高级职称或博士学位，具有类似项目经验，提供医疗健康、卫生科研工作领域同类案例服务5份业绩的，得3分，不满足不得分。2.针对供应商的技术团队人员配置进行横向比较，.项目团队配备人数；.技术人员的专业素质（技术人员的学历、工作年限、工作业绩等），配置优秀得3分，配置合理得2分，配置一般得1分；未提供得0分。3.项目组成员（除项目负责人外）具有高级职称或博士学位的，每位加 1 分，累计不超过3分，不满足不得分。注：提供人员毕业证、学位证书、职称证书，社保缴纳证明材料（提供近半年内任意一个月）、采购合同等，否则不予认可。主观技术部分（70分）实验平台（6分）针对供应商配置的生物测序仪器设备的专业性、科学性及合理性进行评分（须提供设备序列号或购买合同或采购发票复印件加盖单位公章佐证和设备现况照片），配置优秀得6分，配置合理得4分，配置一般得2分；未提供得0分。主观技术部分（70分）管理制度及质量保障措施（6分）供应商提供质量保障措施：管理制度、质量保证措施完善，得5-6分；有管理制度、质量保证措施一般的，得3-4分；管理制度、质量保证措施不够完善的，得1-2分。未提供不得分。主观技术部分（70分）服务承诺（10分）对供应商的售后服务方案的完整性、灵活性、便利性进行横向综合评分，1.优秀的，得10分；2.良好的，得7分；3.一般的，得4分；4.较差的，得1分；未提供不得分。主观15例样本的空间转录组检测项目技术要求1、基本要求1.1质控要求1.1.1对提供的样品进行质检：要求组织块大小长×宽×高（厚度）为6.5mm×6.5mm×10mm；组织提取的RNA质量完整，无降解，RIN值>7.0；冰冻切片H&E染色，要求组织形态学信息完整；切片厚度控制在10-20μm；1.1.2对样品进行组织优化，确定样本的最佳通透化时间，以保证组织样本内RNA的释放，供应商需具备各类型脑组织的组织优化经验。1.2平台要求：1.2.1供应商应提供10XVisium测序平台方案，采用10XVisium的空间建库仪器及原装配套试剂进行空间转录组文库的构建。#1.2.2测序平台二代高通量测序Illumina平台，测序读长PE150。1.3测序质量标准：完成15例样本测序，具体质控要求如下：#1.3.1测序质量:Q20≥95%，Q30≥90%,碱基类型分布均匀，无GC分离。#1.3.2测序数据量：平均样本数据量≥100GrawData。1.4信息分析：供应商需提供SPACERanger和Seurat两套软件分析内容标准信息分析内容，包括以下标准信息分析内容：1.4.1测序数据质控；1.4.2数据比对和基因表达定量（spatialbarcode统计）；1.4.3聚类分析（归一化，筛选高变基因，PCA，分类）；1.4.4差异基因分析，获得不同cluster中的差异基因；1.4.5差异基因功能富集，包括GO和KEGG；Reactome（人和鼠）；1.4.6空间差异基因分析（空间分布富集基因）；供应商需具备但不限于以下个性化信息分析内容，包括：1.4.7空间转录组与单细胞转录组联合分析1.4.8适用于匹配的单细胞空间组学数据，利用Seurat的寻找最近邻(WNN)的分析方法，探索空间spot含有的细胞类型的成分比例。1.4.9对注释好的单细胞数据提取主要表达特征，对空间转录组数据进行反卷积，获得空间转录组的细胞类型占比。1.4.10分析细胞类型之间的距离关系，探索细胞类型之间的互作效应。1.4.11对空间数据的注释，可以进行空间临近通讯NMF、空间基因“开关”等分析.1.4.12承诺个性化分析协助至文章发表；2、样品质控与测序（1）供应商负责对收到的样品进行质控，并将质控信息提供给本所。（2）本所可根据质控信息，指定需要测序的样品，供应商须在本所确认实验开始之日起20个工作日内完成测序及数据分析工作，并提供原始数据相关的质控信息。3、数据接收与确认（1）供应商交付所有样本测序数据及数据分析结果;以上文件通过云交付或者硬盘拷贝交付。（2）数据验收：由供应商的项目专员对接，在项目交付日，供应商项目负责人对项目产出数据、分析结果综合进行汇报，沟通确认，并于此日后1个月内提出异议，若无异议、需求视为验收合格。4、质量保证（1）供应商提供的测序及数据分析服务，以技术参数中的要求为准，超出正常标准范围的，由供应商承担相关服务成本，不再收取其他费用。（2）不符合技术参数要求的样品，供应商须对其提供免费的加测或重测服务，并保证达到技术参数要求。（3）供应商实施的服务期限长于招标文件规定时，出现任何质量问题（人为破坏或自然灾害等不可抗力除外），由供应商负责全免费（免全部工时费、材料费、管理费、财务费等等）提供服务。5、检测数据分析（1）供应商须为检测数据提供流行病学分析，包括检测样本的临床数据清洗和标准化和相关流行病学分析。（2）供应商须为检测数据提供生物信息学分析及相关统计学分析，包括检测样品的基因数据清洗和质控、基于易感基因的风险预测模型构建等。6、售后服务（1）如检测样品仍有剩余，供应商须按照本所要求进行返样。（2）供应商可根据本所需要，提供所有实验记录的电子版以供查验。（3）数据交付后，供应商应保存每批数据分析结束后交付之日起12个月，必要情况下，可重新交付原始数据。（4）质保期内出现任何质量问题（人为破坏或自然灾害等不可抗力除外），由供应商负责全免费（免全部工时费、材料费、管理费、财务费等等）提供服务。服务期满后，供应商应及时优惠提供所需的相关服务。7、其他要求及说明（1）样品寄送：本所按照供应商要求，将待检测样品寄送至供应商指定地点。如剩余样品需要返样，则有供应商将样品寄送至本所指定地点。（2）数据交付方式和地点：网络或硬盘交付至本所指定方式和地点。响应文件封面响应文件项目名称:供应商名称：目录1-1“营业执照”等证明文件11-2供应商资格声明书21-3委托代理人和技术负责人纳税和社保的证明文件32.落实政府采购政策需满足的资格要求43.其他特定资格要求84.响应书95.法定代表人授权委托书106.报价一览表127.分项报价表138.技术偏离表149.其他材料1510.供应商的销售业绩1611.项目方案1712.项目人员配备1813.供应商简介1914.质量保证措施2015.服务承诺211、满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定1-1营业执照等证明文件1-2供应商资格声明书供应商资格声明书致：北京市神经外科研究所在参与本次项目投标中，我单位承诺：1.具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；2.具有履行合同所必需的设备和专业技术能力；3.有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；4.参加政府采购活动前三年内，在经营活动中没有重大违法记录（重大违法记录指因违法经营受到刑事处罚或者责令停产停业、吊销许可证或者执照、较大数额罚款等行政处罚，不包括因违法经营被禁止在一定期限内参加政府采购活动，但期限已经届满的情形）；5.未被“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）列入失信被执行人和重大税收违法案件当事人名单、未被“中国政府采购网”网站（www.ccgp.gov.cn）列入政府采购严重违法失信行为记录名单（处罚期限尚未届满的）；6.我单位不属于政府采购法律、行政法规规定的公益一类事业单位、或使用事业编制且由财政拨款保障的群团组织（仅适用于政府购买服务项目）；7.我单位不存在为采购项目提供整体设计、规范编制或者项目管理、监理、检测等服务后，再参加该采购项目的其他采购活动的情形（单一来源采购项目除外）；8.与我单位存在“单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系”的其他法人单位信息如下（如有，不论其是否参加同一合同项下的政府采购活动均须填写）：序号单位名称相互关系12上述声明真实有效，否则我方负全部责任。供应商名称（加盖公章）：____________日期：_____年______月______日说明：供应商承诺不实的，依据《政府采购法》第七十七条“提供虚假材料谋取中标、成交的”有关规定予以处理。1-3委托代理人和技术负责人纳税和社保的证明文件（近半年中的任意一个月）2、落实政府采购政策需满足的资格要求（如有，不涉及无需提供）2-1中小企业声明函说明：（1）如本项目不专门面向中小企业预留采购份额，资格证明文件部分无需提供《中小企业声明函》。（2）如本项目专门面向中小/小微企业采购，须提供《中小企业声明函》。（3）如本项目预留部分采购项目预算专门面向中小企业采购，要求投标人以联合体形式参加采购活动，且联合体中中小企业承担的部分达到一定比例的，须提供《联合协议》；要求获得采购合同的投标人将采购项目中的一定比例分包给一家或者多家中小企业的，须提供《拟分包情况说明及分包意向协议（类型一）》。（4）其他1）中小企业参加政府采购活动，应当出具此格式文件。《中小企业声明函》由参加政府采购活动的投标人出具。联合体投标的，《中小企业声明函》由牵头人出具。2）对于联合体中由中小企业承担的部分，或者分包给中小企业的部分，必须全部由中小企业制造、承建或者承接。投标人应当在声明函“项目名称”部分标明联合体中中小企业承担的具体内容或者中小企业的具体分包内容。3）对于多标的的采购项目，投标人应充分、准确地了解所投产品制造企业信息。对相关情况了解不清楚的，不建议填报本声明函。（5）温馨提示：为方便广大中小企业识别企业规模类型，工业和信息化部组织开发了中小企业规模类型自测小程序，在国务院客户端和工业和信息化部网站上均有链接，投标人填写所属的行业和指标数据可自动生成企业规模类型测试结果。中小企业声明函（货物）格式本公司（联合体）郑重声明，根据《政府采购促进中小企业发展管理办法》（财库﹝2020﹞46号）的规定，本公司参加（单位名称）的（项目名称）采购活动，提供的货物全部由符合政策要求的中小企业制造。相关企业的具体情况如下：1.（标的名称），属于（采购文件中明确的所属行业）行业；制造商为（企业名称），从业人员______人，营业收入为______万元，资产总额为______万元1，属于（□中型企业、□小型企业、□微型企业）；2.（标的名称），属于（采购文件中明确的所属行业）行业；制造商为（企业名称），从业人员______人，营业收入为______万元，资产总额为______万元，属于（□中型企业、□小型企业、□微型企业）；……以上企业，不属于大企业的分支机构，不存在控股股东为大企业的情形，也不存在与大企业的负责人为同一人的情形。本企业对上述声明内容的真实性负责。如有虚假，将依法承担相应责任。企业名称（盖章）：________日期：________1从业人员、营业收入、资产总额填报上一年度数据，无上一年度数据的新成立企业可不填报。本声明函中企业名称（盖章）指加盖投标人公章。中小企业声明函（工程、服务）格式本公司（联合体）郑重声明，根据《政府采购促进中小企业发展管理办法》（财库﹝2020﹞46号）的规定，本公司参加（单位名称）的（项目名称）采购活动，工程的施工单位全部为符合政策要求的中小企业（或者：服务全部由符合政策要求的中小企业承接）。相关企业的具体情况如下：1.（标的名称），属于（采购文件中明确的所属行业）行业；承建（承接）企业为（企业名称），从业人员______人，营业收入为______万元，资产总额为______万元1，属于（□中型企业、□小型企业、□微型企业）；2.（标的名称），属于（采购文件中明确的所属行业）行业；承建（承接）企业为（企业名称），从业人员______人，营业收入为______万元，资产总额为______万元，属于（□中型企业、□小型企业、□微型企业）；……以上企业，不属于大企业的分支机构，不存在控股股东为大企业的情形，也不存在与大企业的负责人为同一人的情形。本企业对上述声明内容的真实性负责。如有虚假，将依法承担相应责任。企业名称（盖章）：________日期：________1从业人员、营业收入、资产总额填报上一年度数据，无上一年度数据的新成立企业可不填报。本声明函中企业名称（盖章）指加盖投标人公章。残疾人福利性单位声明函格式本单位郑重声明，根据《财政部民政部中国残疾人联合会关于促进残疾人就业政府采购政策的通知》（财库〔2017〕141号）的规定，本单位（请进行勾选）：□不属于符合条件的残疾人福利性单位。□属于符合条件的残疾人福利性单位，且本单位参加______单位的______项目采购活动提供本单位制造的货物（由本单位承担工程/提供服务），或者提供其他残疾人福利性单位制造的货物（不包括使用非残疾人福利性单位注册商标的货物）。本单位对上述声明的真实性负责。如有虚假，将依法承担相应责任。单位名称（盖章）：日期：3、其他特定资格要求3-1涉及医疗器械的产品须提供有效期内的中华人民共和国医疗器械注册证或备案凭证（复印件加盖公章）（科研设备除外）3-2涉及国产医疗器械的产品，供应商如为制造商须提供医疗器械生产许可证或备案凭证（复印件加盖公章）（科研设备除外）3-3供应商如为国内代理商须提供医疗器械经营许可证或备案凭证（复印件加盖公章）（科研设备除外）3-4若所投产品为进口产品，供应商如为代理商须提供制造商（或其授权的境内服务机构）的授权书（原件或彩印件加盖公章或签字），供应商如为制造商可不提供本项。4、响应书响应书致：北京市神经外科研究所我方参加你方就___________（项目名称）组织的招标活动，并对此项目进行投标。1.我方已详细审查全部响应文件，自愿参与响应并承诺如下：（1）本投标有效期为自提交响应文件的截止之日起___个日历日。（2）除合同条款及采购需求偏离表列出的偏离外，我方响应招标文件的全部要求。（3）我方已提供的全部文件资料是真实、准确的，并对此承担一切法律后果。（4）如我方中标，我方将在法律规定的期限内与你方签订合同，按照招标文件要求提交履约保证金，并在合同约定的期限内完成合同规定的全部义务。2.其他补充条款（如有）：___________。与本响应有关的一切正式往来信函请寄：地址_________________________传真____________________________电话_________________________电子函件________________________供应商名称（加盖公章）___________日期：_____年______月______日5、授权委托书授权委托书本人_______（姓名）系________________（供应商名称）的法定代表人（单位负责人），现委托_______（姓名）为我方代理人。代理人根据授权，以我方名义签署、澄清确认、递交、撤回、修改________________（项目名称）响应文件和处理有关事宜，其法律后果由我方承担。委托期限：自本授权委托书签署之日起至响应有效期届满之日止。代理人无转委托权。供应商名称（加盖公章）：________________法定代表人（单位负责人）（签字）：________________委托代理人（签字）：________________日期：_____年______月______日法定代表人（单位负责人）有效期内的身份证正反面电子件：委托代理人有效期内的身份证正反面电子件：说明：1.若供应商为事业单位或其他组织或分支机构（仅当招标文件注明允许分支机构投标的），则法定代表人（单位负责人）处的签署人可为单位负责人。2.若投标文件中签字之处均为法定代表人（单位负责人）本人签署，则可不提供本《授权委托书》，但须提供《法定代表人（单位负责人）身份证明》（实质性格式）。3.供应商为自然人的情形，可不提供本《授权委托书》。附：法定代表人（单位负责人）身份证明致：北京市神经外科研究所兹证明，姓名：____性别：____年龄：____职务：____系（供应商名称）的法定代表人（单位负责人）。附：法定代表人（单位负责人）有效期内的身份证正反面电子件。供应商名称（加盖公章）：________________法定代表人（单位负责人）（签字、签章或印鉴）：_______日期：_____年______月______日6、报价一览表报价一览表项目名称：____________序号投标人名称投标报价序号投标人名称大写小写供应商名称（加盖公章）：____________日期：_____年______月______日7、分项报价表分项报价表项目名称：__________报价单位：人民币元序号分项名称单价（元）合价（元）备注/说明123…总价（元）注：1.上述各项的详细规格（如有），可另页描述。供应商名称（加盖公章）：____________日期：_____年______月______日8、技术偏离表技术偏离表项目名称：____________序号技术要点要求（如有#请标注）响应内容偏离情况说明注：1.对交货期或服务期、技术要求应逐项详细应答，应明确回答“完全响应”或“负偏离”或“正偏离”。此表中若无任何文字说明，内容为空白，投标无效。2.具体指标有证明材料要求的需提供，否则将不被认可。建议在说明中注明证明材料页码方便评审，此表响应内容与证明材料不一致的，以证明材料为准。供应商名称（加盖公章）：____________日期：_____年______月______日9、供应商认为应附的其他材料供应商资质情况（承担专业资质等）10、供应商的业绩序号服务时间项目内容合同金额最终用户名称联系人及电话履约情况1234…注：1.供应商应如实列出以上情况，如有隐瞒，一经查实将导致其遴选申请被拒绝。2.供应商应按照评分标准中的要求提供业绩证明材料。11、项目方案12、项目人员配备（附学历、资格证书、业绩等相关证明材料）项目团队成员一览表1.1.1.序号1.1.2.姓名1.1.3.年龄1.1.4.学历1.1.5.技术职称/执业/职业资格1.1.6.从事相关工作年限1.1.7.在本项目中拟担任工作1.1.81.1.91.1.101.1.111.1.121.1.131.1.141.1.151.1.161.1.171.1.181.1.191.1.201.1.211.1.221.1.231.1.241.1.251.1.261.1.271.1.281.1.291.1.301.1.311.1.321.1.331.1.341.1.351.1.361.1.371.1.381.1.391.1.401.1.411.1.4213、供应商简介14、质量保证措施15、服务承诺